13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2953 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2953  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  383  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2994  hypothetical protein  97.01 
 
 
296 aa  338  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0118  hypothetical protein  43.51 
 
 
302 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0113  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0242  hypothetical protein  43.51 
 
 
302 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000407838  hitchhiker  0.00123645 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2452  hypothetical protein  43.51 
 
 
302 aa  142  3e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00352703  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  30.71 
 
 
278 aa  70.1  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  30.61 
 
 
275 aa  66.2  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  29.11 
 
 
276 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  28.26 
 
 
276 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  28.26 
 
 
276 aa  52.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1341  hypothetical protein  28.87 
 
 
268 aa  52  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  normal  0.280158 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  26.06 
 
 
290 aa  50.4  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1612  hypothetical protein  28.37 
 
 
239 aa  43.9  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.111767  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>