79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6596 on replicon NC_010553
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  100 
 
 		 289 aa  587  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  80.42 
 
 		 289 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  80.42 
 
 		 289 aa  479  1e-134  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  66.67 
 
 		 289 aa  390  1e-107  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  45.36 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  45.59 
 
 		 302 aa  228  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  45.59 
 
 		 302 aa  228  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  45.59 
 
 		 302 aa  228  6e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  43.21 
 
 		 301 aa  228  9e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  46.88 
 
 		 302 aa  223  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  43.45 
 
 		 292 aa  221  8e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  43.22 
 
 		 308 aa  210  2e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  39.71 
 
 		 298 aa  208  7e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  39.21 
 
 		 300 aa  206  5e-52  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  40 
 
 		 307 aa  204  1e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  41.04 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  41.04 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  41.04 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  41.04 
 
 		 293 aa  196  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  41.82 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  41.82 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  41.82 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  41.82 
 
 		 298 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  36.96 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  36.96 
 
 		 301 aa  185  7e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  37.68 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  37.41 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  37.41 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  37.09 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  35.74 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  43 
 
 		 497 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  36.36 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  36.82 
 
 		 293 aa  166  4e-40  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  36.43 
 
 		 297 aa  159  7e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  35.38 
 
 		 303 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  41 
 
 		 440 aa  143  3e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  29.89 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  29.89 
 
 		 313 aa  142  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  35.57 
 
 		 203 aa  125  6e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  26.82 
 
 		 325 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  29.74 
 
 		 292 aa  108  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  40.18 
 
 		 135 aa  96.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  27.51 
 
 		 296 aa  83.6  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  30.12 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  30.12 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  30.12 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  30.12 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  24.89 
 
 		 326 aa  74.7  0.000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  31.88 
 
 		 167 aa  70.9  0.00000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  22.69 
 
 		 302 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  25.88 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  28.05 
 
 		 275 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  25.88 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  25.88 
 
 		 312 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  25.8 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  25.8 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  25.86 
 
 		 327 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  23.48 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  24.67 
 
 		 290 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  24.31 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  23.83 
 
 		 315 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  23.73 
 
 		 335 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  23.23 
 
 		 382 aa  54.3  0.000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  23.39 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  23.39 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1703  hypothetical protein  26.84 
 
 		 322 aa  52.8  0.000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3040  TniB  32.18 
 
 		 98 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  24.58 
 
 		 379 aa  49.3  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  25 
 
 		 377 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  25.26 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  22.16 
 
 		 310 aa  48.1  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  20 
 
 		 319 aa  45.4  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  20.83 
 
 		 319 aa  45.1  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5416  AAA ATPase  22.09 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5592  AAA ATPase  22.09 
 
 		 393 aa  45.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  22.55 
 
 		 337 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  22.55 
 
 		 337 aa  42.7  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3660  hypothetical protein  27.13 
 
 		 329 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  22.41 
 
 		 304 aa  42.7  0.007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>