28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0543 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  100 
 
 		 319 aa  654    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2452  AAA ATPase  31.37 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  hitchhiker  0.000127751 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  29.58 
 
 		 382 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3185  AAA ATPase  28.04 
 
 		 338 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  29.69 
 
 		 335 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  29.07 
 
 		 371 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  28.67 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  28.67 
 
 		 345 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  26.73 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4945  ATPase  26.27 
 
 		 492 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.206072 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0066  ATPase  26.27 
 
 		 492 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0192  ATPase  26.27 
 
 		 492 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.866299  normal  0.0299371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1331  ATPase  26.27 
 
 		 492 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1714  ATPase  26.27 
 
 		 492 aa  95.5  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2896  hypothetical protein  26.48 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0211  hypothetical protein  26.48 
 
 		 356 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1037  AAA ATPase  26.2 
 
 		 388 aa  90.9  3e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3874  AAA ATPase  27.76 
 
 		 351 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  28.96 
 
 		 338 aa  87  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4431  hypothetical protein  26.54 
 
 		 396 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5370  AAA ATPase  28.84 
 
 		 242 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424012 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  25.68 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  23.75 
 
 		 302 aa  47.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  22.85 
 
 		 289 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  22.85 
 
 		 289 aa  46.6  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  21.58 
 
 		 327 aa  45.8  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  21.92 
 
 		 325 aa  44.7  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  20.83 
 
 		 289 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>