21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5370 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5370  AAA ATPase  100 
 
 
242 aa  496  1e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424012 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2452  AAA ATPase  42.08 
 
 
371 aa  149  3e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  hitchhiker  0.000127751 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  36.99 
 
 
382 aa  129  6e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  30.4 
 
 
371 aa  97.8  1e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0192  ATPase  30.89 
 
 
492 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.866299  normal  0.0299371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1331  ATPase  30.89 
 
 
492 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1714  ATPase  30.89 
 
 
492 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4945  ATPase  30.89 
 
 
492 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.206072 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0066  ATPase  30.89 
 
 
492 aa  93.6  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1037  AAA ATPase  30.73 
 
 
388 aa  92.4  6e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  32.02 
 
 
344 aa  90.5  2e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  30.4 
 
 
335 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  28.57 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  28.57 
 
 
345 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3185  AAA ATPase  28.29 
 
 
338 aa  65.1  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  28.27 
 
 
338 aa  63.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  28.84 
 
 
319 aa  61.2  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4431  hypothetical protein  27.8 
 
 
396 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  20.85 
 
 
310 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0211  hypothetical protein  25 
 
 
356 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2896  hypothetical protein  25 
 
 
356 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>