36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4716 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  100 
 
 
344 aa  700    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  69.82 
 
 
335 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  69.21 
 
 
345 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  69.21 
 
 
345 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3185  AAA ATPase  45.25 
 
 
338 aa  286  4e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  33.54 
 
 
382 aa  160  3e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2452  AAA ATPase  32.84 
 
 
371 aa  142  9e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  hitchhiker  0.000127751 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3874  AAA ATPase  31.41 
 
 
351 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0211  hypothetical protein  27.36 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2896  hypothetical protein  27.36 
 
 
356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1037  AAA ATPase  29.07 
 
 
388 aa  110  5e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  26.73 
 
 
319 aa  102  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  27.05 
 
 
371 aa  100  4e-20  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4945  ATPase  28.14 
 
 
492 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.206072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1714  ATPase  28.14 
 
 
492 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1331  ATPase  28.14 
 
 
492 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0192  ATPase  28.14 
 
 
492 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.866299  normal  0.0299371 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0066  ATPase  28.14 
 
 
492 aa  99  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  28.97 
 
 
338 aa  96.3  7e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5370  AAA ATPase  32.02 
 
 
242 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424012 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4431  hypothetical protein  27.21 
 
 
396 aa  77  0.0000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  25.82 
 
 
300 aa  71.6  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  25.93 
 
 
289 aa  53.1  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  27.24 
 
 
296 aa  50.8  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  24.49 
 
 
377 aa  49.7  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  25.96 
 
 
302 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  25.96 
 
 
302 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  25.96 
 
 
302 aa  49.7  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  23.31 
 
 
289 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  23.31 
 
 
289 aa  49.7  0.00008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  25.26 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  25.96 
 
 
286 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  25.36 
 
 
302 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  22.88 
 
 
325 aa  46.2  0.0008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2537  hypothetical protein  27.83 
 
 
357 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2625  formate hydrogenlyase transcriptional activator  32.26 
 
 
648 aa  43.1  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>