75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0219 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  100 
 
 		 325 aa  660    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  35.99 
 
 		 296 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  33.56 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  33.93 
 
 		 303 aa  166  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  35.52 
 
 		 294 aa  166  5e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  33.45 
 
 		 308 aa  159  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  33.09 
 
 		 296 aa  159  6e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  31.45 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  28.81 
 
 		 301 aa  150  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  31.62 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  31.62 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  29.39 
 
 		 301 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  29.61 
 
 		 301 aa  147  3e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  29.15 
 
 		 293 aa  144  2e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  28.76 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  28.76 
 
 		 301 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  29.68 
 
 		 307 aa  138  1e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  29.82 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  29.82 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  29.82 
 
 		 302 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  30.83 
 
 		 301 aa  137  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  30.07 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  29.45 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  31.49 
 
 		 302 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  31.71 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  31.71 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  31.71 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  31.71 
 
 		 293 aa  126  4.0000000000000003e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  27.5 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  27.5 
 
 		 289 aa  126  5e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  37.78 
 
 		 203 aa  125  9e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  25.09 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  28 
 
 		 289 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  27.01 
 
 		 289 aa  122  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  26.94 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  26.94 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  26.94 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  26.94 
 
 		 298 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  24.28 
 
 		 292 aa  100  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  25.59 
 
 		 440 aa  86.7  6e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  27.93 
 
 		 497 aa  84  0.000000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  26.67 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  25.7 
 
 		 312 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  22.53 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  30.21 
 
 		 275 aa  67.4  0.0000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  26.18 
 
 		 304 aa  65.5  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  20.08 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  26.7 
 
 		 315 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  22.66 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  22.66 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  22.66 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  22.66 
 
 		 319 aa  63.2  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  25.31 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  25.31 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  27.36 
 
 		 312 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  27.36 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  27.36 
 
 		 312 aa  60.8  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  26.81 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  24.9 
 
 		 342 aa  55.8  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  24.68 
 
 		 540 aa  55.1  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1341  hypothetical protein  25.27 
 
 		 268 aa  55.1  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  normal  0.280158 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  24.6 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3040  TniB  34.44 
 
 		 98 aa  52.8  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  24.73 
 
 		 310 aa  52.8  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  23.67 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  23.67 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  22.84 
 
 		 276 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  27.27 
 
 		 327 aa  46.6  0.0006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  23.65 
 
 		 379 aa  46.6  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  22.88 
 
 		 344 aa  46.2  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  22.9 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  21.92 
 
 		 319 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  23.44 
 
 		 562 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  22.45 
 
 		 335 aa  43.5  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  25.38 
 
 		 196 aa  42.7  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>