91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6260 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6260  TniB  100 
 
 		 289 aa  584  1e-166  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  66.67 
 
 		 289 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  63.7 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  63.7 
 
 		 289 aa  375  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  45.59 
 
 		 286 aa  226  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  45.59 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  45.59 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  45.59 
 
 		 302 aa  224  1e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  42.31 
 
 		 301 aa  223  3e-57  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  45.49 
 
 		 302 aa  211  9e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  42.65 
 
 		 308 aa  208  9e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  39.39 
 
 		 298 aa  203  2e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  38.71 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  40.51 
 
 		 307 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  40.89 
 
 		 292 aa  195  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  40.21 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  40.21 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  40.21 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  40.21 
 
 		 298 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  37.23 
 
 		 296 aa  186  5e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  36.69 
 
 		 294 aa  186  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  38.46 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  38.52 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  38.89 
 
 		 301 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  38.25 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  38.25 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  38.25 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  38.25 
 
 		 293 aa  180  2e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  36.36 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  36.36 
 
 		 301 aa  176  3e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  36.36 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  37.4 
 
 		 293 aa  172  7.999999999999999e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  40.29 
 
 		 497 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  33.68 
 
 		 303 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  33.82 
 
 		 297 aa  149  7e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  41.5 
 
 		 440 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  27.42 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  27.42 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  35.57 
 
 		 203 aa  132  6e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  27.72 
 
 		 325 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  31.85 
 
 		 292 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  30.71 
 
 		 296 aa  92.4  7e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  37.74 
 
 		 135 aa  87.4  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  26.24 
 
 		 326 aa  81.3  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  30.66 
 
 		 167 aa  68.9  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  28.24 
 
 		 290 aa  67.4  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  25.9 
 
 		 304 aa  64.3  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  24.6 
 
 		 312 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  28.29 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  28.29 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  28.29 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  28.29 
 
 		 319 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3040  TniB  33.33 
 
 		 98 aa  60.8  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  25.09 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  25.09 
 
 		 345 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  25 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  25 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  25 
 
 		 312 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  22.9 
 
 		 302 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  27.71 
 
 		 276 aa  58.9  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  30.13 
 
 		 338 aa  57.4  0.0000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628974 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  27.07 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  27.66 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4716  hypothetical protein  24.22 
 
 		 354 aa  56.6  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  23.72 
 
 		 319 aa  55.5  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  24.66 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  24.18 
 
 		 327 aa  52.8  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  25.93 
 
 		 344 aa  53.1  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  24.74 
 
 		 310 aa  51.6  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  24.2 
 
 		 335 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1703  hypothetical protein  25.24 
 
 		 322 aa  49.7  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  26.29 
 
 		 551 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  26.29 
 
 		 551 aa  47  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  22.22 
 
 		 315 aa  45.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6693  type VI secretion ATPase  27.49 
 
 		 889 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.348234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  23.79 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  23.79 
 
 		 276 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1203  Tn5468, transposition protein C  27.88 
 
 		 552 aa  45.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  26.49 
 
 		 551 aa  45.1  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3660  hypothetical protein  27.75 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  23.3 
 
 		 362 aa  42.7  0.007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0508  ATPase AAA-2  25.79 
 
 		 763 aa  42.7  0.007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0029  transposition helper protein  25.63 
 
 		 311 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1625  SciG protein  27.49 
 
 		 918 aa  42.4  0.008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398172  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  27.04 
 
 		 316 aa  42.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0178  chaperone clpB  27.49 
 
 		 895 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0156  chaperone clpB  27.49 
 
 		 895 aa  42.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.102124  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3260  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  25.26 
 
 		 751 aa  42.4  0.009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.625652  hitchhiker  0.000000000240125 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1262  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit clpA  26.17 
 
 		 755 aa  42  0.01  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.537435  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  24.89 
 
 		 342 aa  42.4  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  20.95 
 
 		 330 aa  42.4  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>