21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4431 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4431  hypothetical protein  100 
 
 
396 aa  821    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0466568  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  26.26 
 
 
382 aa  109  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1037  AAA ATPase  25.07 
 
 
388 aa  94.4  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0192  ATPase  25.71 
 
 
492 aa  86.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.866299  normal  0.0299371 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1331  ATPase  25.71 
 
 
492 aa  86.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1714  ATPase  25.71 
 
 
492 aa  86.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4945  ATPase  25.71 
 
 
492 aa  86.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.206072 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0066  ATPase  25.71 
 
 
492 aa  86.3  8e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2452  AAA ATPase  26.33 
 
 
371 aa  82.4  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  hitchhiker  0.000127751 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4716  AAA ATPase  27.21 
 
 
344 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0132435  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  26.3 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  26.3 
 
 
345 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3185  AAA ATPase  23.36 
 
 
338 aa  75.9  0.000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.820352  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0543  hypothetical protein  26.54 
 
 
319 aa  74.7  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  25.52 
 
 
371 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0211  hypothetical protein  22.97 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2896  hypothetical protein  22.97 
 
 
356 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  26.05 
 
 
335 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3874  AAA ATPase  21.88 
 
 
351 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5370  AAA ATPase  27.8 
 
 
242 aa  53.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424012 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  21.04 
 
 
338 aa  50.1  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.628974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>