65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2351 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  100 
 
 		 310 aa  641    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3660  hypothetical protein  28.34 
 
 		 329 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1365  hypothetical protein  24.89 
 
 		 355 aa  94.4  2e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0838542  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  25.79 
 
 		 326 aa  84  0.000000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  24.59 
 
 		 315 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  24.6 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  24.6 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  24.6 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  24.6 
 
 		 319 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  32.65 
 
 		 312 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  24.34 
 
 		 304 aa  71.2  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  30.92 
 
 		 308 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  34.15 
 
 		 286 aa  65.5  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  34.96 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  34.96 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  34.15 
 
 		 302 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  34.96 
 
 		 302 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  21.22 
 
 		 327 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  23.64 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  24.84 
 
 		 340 aa  59.3  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  25.27 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  25.27 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  25.27 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  25.27 
 
 		 293 aa  58.5  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1427  hypothetical protein  26.86 
 
 		 345 aa  55.8  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  22.89 
 
 		 330 aa  55.8  0.0000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  23.05 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3826  transposon Tn7 transposition protein TnsC  27.43 
 
 		 545 aa  55.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109282 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  22.73 
 
 		 301 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  22.73 
 
 		 301 aa  53.5  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  25.41 
 
 		 497 aa  53.5  0.000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0017  hypothetical protein  25.45 
 
 		 335 aa  52.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  24.73 
 
 		 325 aa  52.8  0.000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  21.43 
 
 		 298 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  21.57 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  24.74 
 
 		 289 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  21.57 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  21.57 
 
 		 301 aa  51.2  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  22.97 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  22.31 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  22.31 
 
 		 289 aa  48.5  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  22.16 
 
 		 289 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  23.57 
 
 		 203 aa  47.4  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3213  hypothetical protein  24.57 
 
 		 317 aa  47.4  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5370  AAA ATPase  20.85 
 
 		 242 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.424012 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5416  AAA ATPase  22.04 
 
 		 393 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5592  AAA ATPase  22.04 
 
 		 393 aa  47  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  22.13 
 
 		 552 aa  47  0.0005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2176  hypothetical protein  25 
 
 		 316 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476118  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  23.29 
 
 		 319 aa  46.2  0.0007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  23.05 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  23.05 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  23.05 
 
 		 312 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  25 
 
 		 196 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  22.31 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  22.31 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2452  AAA ATPase  24.36 
 
 		 371 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.640596  hitchhiker  0.000127751 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  22.31 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  22.31 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  22.7 
 
 		 278 aa  43.5  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  21.65 
 
 		 379 aa  43.1  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  23.5 
 
 		 292 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  20.35 
 
 		 276 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0029  transposition helper protein  23.04 
 
 		 311 aa  43.1  0.006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>