89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_2647 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  100 
 
 		 298 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  100 
 
 		 298 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  100 
 
 		 298 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  100 
 
 		 298 aa  592  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  49.32 
 
 		 308 aa  280  3e-74  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  50.68 
 
 		 302 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  50.68 
 
 		 302 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  50.68 
 
 		 302 aa  278  8e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  51.61 
 
 		 286 aa  268  5.9999999999999995e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  50 
 
 		 302 aa  260  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  42.51 
 
 		 298 aa  251  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  46.21 
 
 		 292 aa  236  4e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  39.25 
 
 		 300 aa  231  8.000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  41.82 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  39.5 
 
 		 289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  39.5 
 
 		 289 aa  215  5.9999999999999996e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  37.63 
 
 		 296 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  37.63 
 
 		 296 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  40.21 
 
 		 289 aa  210  3e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  37.46 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  37.46 
 
 		 301 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  38.38 
 
 		 301 aa  208  9e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  37.41 
 
 		 301 aa  206  5e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  36.52 
 
 		 301 aa  203  3e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  36.86 
 
 		 301 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  37.72 
 
 		 294 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  35.21 
 
 		 293 aa  192  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  39.56 
 
 		 307 aa  189  7e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  33.45 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  33.45 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  39.13 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  39.13 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  39.13 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  39.13 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  34.25 
 
 		 303 aa  172  9e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  40.85 
 
 		 497 aa  154  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  35.27 
 
 		 297 aa  139  3.9999999999999997e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  33.9 
 
 		 292 aa  138  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  38.38 
 
 		 203 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  37.29 
 
 		 440 aa  135  8e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  26.94 
 
 		 325 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  34.69 
 
 		 296 aa  126  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  41.51 
 
 		 135 aa  79.7  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  33.8 
 
 		 167 aa  77.4  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  24.81 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  24.81 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  24.81 
 
 		 312 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  25.51 
 
 		 326 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  25.82 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  25.82 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  25.82 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  25.82 
 
 		 319 aa  65.9  0.0000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1115  Tn7-like transposition protein C  23.77 
 
 		 551 aa  65.9  0.0000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5416  AAA ATPase  27.43 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.740206 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5592  AAA ATPase  27.43 
 
 		 393 aa  61.2  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  25.1 
 
 		 302 aa  59.3  0.00000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1872  Tn7-like transposition protein C  21.86 
 
 		 551 aa  58.5  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  25.31 
 
 		 467 aa  58.9  0.0000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  23.51 
 
 		 536 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  24.56 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3040  TniB  33.33 
 
 		 98 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  22.76 
 
 		 500 aa  54.7  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  25.2 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  25.2 
 
 		 345 aa  55.1  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  24.5 
 
 		 304 aa  52  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  27.31 
 
 		 377 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4716  hypothetical protein  23.41 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  25.1 
 
 		 379 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  23.95 
 
 		 312 aa  50.4  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2930  hypothetical protein  23.55 
 
 		 530 aa  50.4  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  24.1 
 
 		 540 aa  50.4  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  24.15 
 
 		 340 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  22.74 
 
 		 382 aa  50.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  22.96 
 
 		 310 aa  49.3  0.00007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4358  transposon Tn7 transposition protein TnsC  29.14 
 
 		 552 aa  48.9  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  23.08 
 
 		 278 aa  48.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4753  hypothetical protein  24.53 
 
 		 362 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.713653  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4741  AAA ATPase  25.31 
 
 		 335 aa  47  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  25 
 
 		 196 aa  43.9  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  23.08 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  21.54 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  21.54 
 
 		 276 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0176  Tn7-like transposition protein C  22.76 
 
 		 550 aa  43.9  0.003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2801  Tn7-like transposition protein C  23.16 
 
 		 551 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3197  Tn5468, transposition protein C  23.16 
 
 		 551 aa  43.5  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2440  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit ClpA  29.06 
 
 		 753 aa  43.1  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4565  ABC transporter related  29.3 
 
 		 236 aa  43.1  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.683769  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0144  Tn7-like transposition protein C  22.31 
 
 		 559 aa  42.4  0.01  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.23135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1629  ATPase  26.58 
 
 		 826 aa  42.4  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>