19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_2176 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009665  Shew185_2176  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  656    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.476118  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1630  hypothetical protein  29.25 
 
 		 313 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  27.2 
 
 		 302 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  28.3 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  26.4 
 
 		 312 aa  52.8  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  21.33 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  21.33 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  21.33 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  21.33 
 
 		 319 aa  50.1  0.00005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  22.34 
 
 		 315 aa  47  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2351  hypothetical protein  25 
 
 		 310 aa  46.6  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0363942 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  32.89 
 
 		 562 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  24.07 
 
 		 304 aa  43.9  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  27.48 
 
 		 196 aa  43.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41501  predicted protein  25.21 
 
 		 449 aa  42.4  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.364066  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  22.83 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  22.83 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  22.83 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  22.83 
 
 		 293 aa  42.4  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>