45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_5455 on replicon NC_010333
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  100 
 
 		 135 aa  273  5e-73  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  70.19 
 
 		 297 aa  157  4e-38  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  50.47 
 
 		 292 aa  106  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  40.18 
 
 		 289 aa  96.7  1e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  41.51 
 
 		 289 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  41.51 
 
 		 289 aa  90.1  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  37.74 
 
 		 289 aa  87.4  6e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  40 
 
 		 440 aa  82.8  0.000000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  40.2 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  39.34 
 
 		 307 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  41.75 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  41.75 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  41.75 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  41.75 
 
 		 293 aa  78.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  38.74 
 
 		 298 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  35.35 
 
 		 300 aa  75.9  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  36.54 
 
 		 294 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  36.54 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  41.51 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  41.51 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  39.62 
 
 		 302 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  41.51 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  41.51 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  37.5 
 
 		 308 aa  72.8  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  38.68 
 
 		 286 aa  72  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  36.54 
 
 		 301 aa  70.9  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  38.68 
 
 		 302 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  38.68 
 
 		 302 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  38.68 
 
 		 302 aa  70.9  0.000000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  36.54 
 
 		 301 aa  70.9  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  33.65 
 
 		 296 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  35.24 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  35.24 
 
 		 301 aa  69.7  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  38.32 
 
 		 497 aa  67.8  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  34.62 
 
 		 301 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  31.97 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  31.97 
 
 		 313 aa  66.6  0.0000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  35.58 
 
 		 296 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  36.67 
 
 		 293 aa  62  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  29.29 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  33.66 
 
 		 319 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  33.66 
 
 		 319 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  33.66 
 
 		 319 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  33.66 
 
 		 319 aa  47  0.00008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  31.78 
 
 		 292 aa  44.7  0.0005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>