78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_4580 on replicon NC_007961
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007961  Nham_4580  TniB  100 
 
 		 307 aa  617  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  45.39 
 
 		 292 aa  224  1e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  40 
 
 		 289 aa  204  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  40.51 
 
 		 289 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  42.45 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  42.45 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  42.45 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  42.45 
 
 		 293 aa  198  7e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  39.07 
 
 		 300 aa  195  7e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  39.57 
 
 		 308 aa  195  8.000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  37.73 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  37.73 
 
 		 289 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  36.26 
 
 		 296 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  40.37 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  40.37 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  40.37 
 
 		 302 aa  182  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  40.37 
 
 		 286 aa  182  8.000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  33.7 
 
 		 293 aa  179  4.999999999999999e-44  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  35.14 
 
 		 296 aa  178  8e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  43.04 
 
 		 302 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  33.82 
 
 		 301 aa  171  2e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  31.48 
 
 		 294 aa  166  4e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  34.2 
 
 		 301 aa  166  5e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  33.83 
 
 		 301 aa  165  6.9999999999999995e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  39.56 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  39.56 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  39.56 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  39.56 
 
 		 298 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  41.98 
 
 		 497 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  32.54 
 
 		 301 aa  159  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  33.33 
 
 		 298 aa  159  8e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  32.71 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  32.71 
 
 		 301 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  37.02 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  38.04 
 
 		 440 aa  146  5e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  34.75 
 
 		 303 aa  140  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  30.19 
 
 		 325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  27.27 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  27.27 
 
 		 313 aa  125  9e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  32.29 
 
 		 203 aa  123  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  29.83 
 
 		 292 aa  107  3e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  36.75 
 
 		 167 aa  96.7  4e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  29.05 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  39.34 
 
 		 135 aa  79.3  0.00000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  27.62 
 
 		 326 aa  78.6  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  24.9 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  24.9 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  24.9 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  24.9 
 
 		 319 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  24.68 
 
 		 304 aa  63.9  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  23.93 
 
 		 302 aa  62.4  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  26.26 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  24.15 
 
 		 315 aa  56.2  0.0000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  24.07 
 
 		 330 aa  55.5  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6967  Tn7-like transposition protein C  26.64 
 
 		 540 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.827899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  23.08 
 
 		 319 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4721  AAA ATPase  25.1 
 
 		 327 aa  51.6  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.895386  normal  0.068339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3219  ATP/GTP-binding protein  26.16 
 
 		 342 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.184147  normal  0.517488 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  26.34 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  26.34 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  26.34 
 
 		 312 aa  49.7  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  23.89 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4716  hypothetical protein  28.05 
 
 		 354 aa  48.9  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  23.89 
 
 		 276 aa  48.9  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0026  hypothetical protein  21.32 
 
 		 379 aa  47.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3040  TniB  34.78 
 
 		 98 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0612  ATP/GTP-binding protein  24.44 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.775808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3182  putative ATP/GTP-binding protein  24.44 
 
 		 337 aa  47  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18881  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  23.56 
 
 		 290 aa  45.8  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  20.63 
 
 		 278 aa  45.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  25 
 
 		 312 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  23.08 
 
 		 562 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  26.07 
 
 		 377 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2555  hypothetical protein  29.15 
 
 		 2052 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.177954  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0730  transposition protein, putative  24.24 
 
 		 316 aa  43.5  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.12407  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  22.42 
 
 		 275 aa  42.7  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3945  transposon Tn7 transposition protein TnsC  27.01 
 
 		 536 aa  42.7  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  24.84 
 
 		 196 aa  42.7  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>