75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4686 on replicon NC_008760
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008760  Pnap_4686  TniB family protein  100 
 
 		 301 aa  621  1e-177  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.60041  normal  0.0211663 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  44.07 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  44.07 
 
 		 289 aa  231  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  43.21 
 
 		 289 aa  228  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  42.31 
 
 		 289 aa  223  4e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0124  putative NTP-binding protein TniB  41.82 
 
 		 298 aa  206  3e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4235  hypothetical protein  37.82 
 
 		 292 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.814526 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  35.66 
 
 		 308 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  37.73 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  36.49 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  36.49 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  36.49 
 
 		 302 aa  181  1e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1347  TniB family protein  37.41 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1223  TniB family protein  37.41 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.985075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2172  TniB family protein  37.41 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.248869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2647  TniB family protein  37.41 
 
 		 298 aa  178  1e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.288166  normal  0.0374868 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0188  urease, alpha subunit  35.03 
 
 		 293 aa  175  9e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  35.48 
 
 		 300 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4580  TniB  33.82 
 
 		 307 aa  170  2e-41  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  36.82 
 
 		 302 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  35.14 
 
 		 296 aa  168  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2504  transposon transposition helper protein C, putative  34.17 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.059168  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4383  TniB  35.71 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0720685  n/a   
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4603  TniB  35.71 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.956661  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0057  transposition helper protein  32.97 
 
 		 296 aa  163  3e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4305  TniB  35.71 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.893182  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4221  TniB  35.71 
 
 		 293 aa  163  3e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341366  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  31.29 
 
 		 301 aa  138  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  32.03 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  32.03 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3006  TniB  37.27 
 
 		 497 aa  133  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.270037  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3048  TniB  33.58 
 
 		 303 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.37719 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0219  TniB family protein  30.83 
 
 		 325 aa  130  3e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.858856  n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5461  TniB family protein  32.57 
 
 		 297 aa  129  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.93146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  31.91 
 
 		 301 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  32.27 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4393  TniB  30.03 
 
 		 292 aa  126  5e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0694  TniB  28.22 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.127413  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1591  TniB  28.22 
 
 		 313 aa  125  7e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.545721  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4287  TniB  34.43 
 
 		 440 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.105258  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2132  TniB family protein  30.77 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.521965  normal  0.0287257 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5454  TniB  36.5 
 
 		 167 aa  83.2  0.000000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.487668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4507  TniB  26.64 
 
 		 296 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  25.1 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  24.9 
 
 		 319 aa  67  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  26.07 
 
 		 340 aa  66.2  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  24.5 
 
 		 302 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  28.02 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  25.55 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  25.76 
 
 		 290 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5455  hypothetical protein  29.29 
 
 		 135 aa  59.7  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.201732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  22.95 
 
 		 304 aa  57.8  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3040  TniB  32.98 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1982  AAA ATPase  27.92 
 
 		 382 aa  54.7  0.000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.135129 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  24.05 
 
 		 312 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  24.05 
 
 		 312 aa  52.8  0.000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4576  AAA ATPase  26.29 
 
 		 345 aa  52.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3503  AAA ATPase  26.29 
 
 		 345 aa  52.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  23.63 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5193  Tn7-like transposition protein C  29.66 
 
 		 467 aa  51.6  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0247  AAA ATPase  20.4 
 
 		 562 aa  51.6  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.472515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3488  Tn7-like transposition protein C  25.76 
 
 		 556 aa  50.8  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00656002  normal  0.0745204 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  23.05 
 
 		 312 aa  50.8  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3952  Tn7-like transposition protein C  23 
 
 		 500 aa  50.1  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2325  Tn7-like transposition protein C  27.16 
 
 		 568 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000840963 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  23.95 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1658  ATP-binding protein  26.63 
 
 		 371 aa  46.6  0.0005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  23.95 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  23.95 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  23.95 
 
 		 319 aa  46.6  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3949  Tn7-like transposition protein C  27.78 
 
 		 565 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3660  hypothetical protein  28.57 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2603  AAA ATPase  22.78 
 
 		 377 aa  43.1  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0342788  normal  0.397066 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06977  hypothetical protein  27.63 
 
 		 196 aa  43.1  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3569  AAA ATPase  29.03 
 
 		 338 aa  42.7  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.628974 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>