36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1703 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_1703  hypothetical protein  100 
 
 		 322 aa  664    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0016  AAA ATPase  25.35 
 
 		 312 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0015  AAA ATPase  25.9 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000241771 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0007  AAA ATPase  25.9 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00746213  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0009  AAA ATPase  25.9 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0992238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0007  AAA ATPase  25.9 
 
 		 319 aa  73.2  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5057  hypothetical protein  23.86 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.847367  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3151  hypothetical protein  23.86 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5217  hypothetical protein  23.86 
 
 		 312 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.736835  normal  0.213042 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6544  hypothetical protein  25 
 
 		 302 aa  57.4  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.324447 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1681  TniB family protein  23.62 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2935  TniB family protein  23.62 
 
 		 301 aa  55.5  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.734369  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6596  TniB family protein  26.84 
 
 		 289 aa  52.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06218  hypothetical protein  20.55 
 
 		 326 aa  50.4  0.00003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0376  hypothetical protein  22.54 
 
 		 330 aa  50.1  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1579  TniB family protein  23.28 
 
 		 301 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0154252  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0203  TniB family protein  22.05 
 
 		 296 aa  49.7  0.00007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000461538 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6260  TniB  25.24 
 
 		 289 aa  49.7  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0157  transposition protein TniB  24.05 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.359337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2266  hypothetical protein  20.31 
 
 		 315 aa  48.9  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.339393 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2234  AAA ATPase  25.77 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.389055  decreased coverage  0.000860852 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4973  NTP-binding protein TniB  24.14 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0899984  normal  0.24566 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4044  NTP-binding protein TniB  24.14 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.160827  normal  0.440608 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3009  hypothetical protein  24.14 
 
 		 302 aa  48.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00246617 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4979  TniB family protein  23.35 
 
 		 301 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635243 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3861  hypothetical protein  23.44 
 
 		 319 aa  47.8  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0197504 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2994  hypothetical protein  28.75 
 
 		 296 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0459  transposition protein, putative  28.57 
 
 		 332 aa  46.6  0.0006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.204246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4199  hypothetical protein  22.68 
 
 		 340 aa  46.6  0.0006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1174  transposition protein TniB  27.71 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4904  TniB  25.45 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3259  TniB family protein  25.45 
 
 		 289 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.112641 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1341  hypothetical protein  21.89 
 
 		 268 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  normal  0.280158 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3660  hypothetical protein  23.13 
 
 		 329 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2523  TniB family protein  22.52 
 
 		 301 aa  44.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.122196 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1646  TniB  22.14 
 
 		 300 aa  42.4  0.01  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>