17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2958 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2958  hypothetical protein  100 
 
 
211 aa  439  9.999999999999999e-123  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2982  TniB family protein  99.29 
 
 
290 aa  296  1e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2187  hypothetical protein  62.41 
 
 
275 aa  193  2e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1151  hypothetical protein  38.62 
 
 
278 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.275843 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0976  TniB family protein  36.42 
 
 
276 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3128  uncharacterized ATPase putative transposase  35.46 
 
 
276 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.765042 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2200  uncharacterized ATPase putative transposase  35.46 
 
 
276 aa  92.8  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.866593  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2983  hypothetical protein  82 
 
 
167 aa  91.7  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1340  hypothetical protein  50 
 
 
170 aa  65.9  0.0000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.317438  normal  0.416506 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1152  hypothetical protein  48.94 
 
 
167 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2188  hypothetical protein  47.83 
 
 
173 aa  58.5  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2995  hypothetical protein  51.11 
 
 
166 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1341  hypothetical protein  34.23 
 
 
268 aa  53.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.720259  normal  0.280158 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0975  hypothetical protein  40.68 
 
 
180 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.204317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2220  hypothetical protein  44.68 
 
 
167 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2283  hypothetical protein  44.68 
 
 
155 aa  48.1  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  hitchhiker  0.00258565 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3578  TniB family protein  23.75 
 
 
308 aa  41.2  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0550246  normal  0.0268044 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>