15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2983 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2983  hypothetical protein  100 
 
 
167 aa  347  5e-95  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2188  hypothetical protein  59.15 
 
 
173 aa  207  4e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1340  hypothetical protein  51.85 
 
 
170 aa  178  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.317438  normal  0.416506 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2995  hypothetical protein  54.49 
 
 
166 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0975  hypothetical protein  50 
 
 
180 aa  159  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.204317 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1152  hypothetical protein  51.25 
 
 
167 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.836488 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2220  hypothetical protein  45.06 
 
 
167 aa  141  5e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2283  hypothetical protein  44.94 
 
 
155 aa  138  3e-32  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.677756  hitchhiker  0.00258565 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2958  hypothetical protein  82 
 
 
211 aa  91.7  4e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6545  hypothetical protein  29.3 
 
 
322 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5392  transcriptional regulator, XRE family  25.61 
 
 
162 aa  45.1  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  27.12 
 
 
638 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  27.12 
 
 
638 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  27.12 
 
 
638 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  27.12 
 
 
638 aa  44.3  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>