13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5392 on replicon NC_011737
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011737  PCC7424_5392  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 162 aa  335  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3098  transcriptional regulator, XRE family  59.15 
 
 		 158 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0617  hypothetical protein  47.62 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.455371  hitchhiker  0.00000289495 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2983  hypothetical protein  25.61 
 
 		 167 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1840  putative phage repressor  27.41 
 
 		 270 aa  44.3  0.0007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.100687  hitchhiker  0.0000604594 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  27.52 
 
 		 605 aa  43.1  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1102  transcriptional regulator, XRE family  32.29 
 
 		 403 aa  43.5  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  24.31 
 
 		 638 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  24.31 
 
 		 638 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  24.31 
 
 		 638 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  24.31 
 
 		 638 aa  42.4  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0474  hypothetical protein  39.06 
 
 		 239 aa  42  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.568097 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  34.43 
 
 		 216 aa  41.2  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>