20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3098 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3098  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 158 aa  331  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5392  transcriptional regulator, XRE family  59.15 
 
 		 162 aa  181  5.0000000000000004e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  26.63 
 
 		 344 aa  47  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0781  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 164 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0290139  normal  0.0967934 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1458  transcriptional regulator, XRE family  41.18 
 
 		 114 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3044  putative phage repressor  40.68 
 
 		 264 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5286  transcriptional regulator, XRE family  37.93 
 
 		 810 aa  42.4  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2271  transcriptional regulator, XRE family  37.97 
 
 		 141 aa  42  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.571583 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0026  XRE family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 139 aa  42.4  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0029  helix-turn-helix domain-containing protein  40 
 
 		 855 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8486  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 204 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1976  transcriptional regulator, XRE family  31.37 
 
 		 227 aa  42  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.256521  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0019  XRE family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 139 aa  41.6  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0558597 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_67  hypothetical protein  45 
 
 		 72 aa  42  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  41.27 
 
 		 216 aa  41.6  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1555  DNA-binding protein  45 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000236293  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5225  XRE family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4036  transcriptional regulator, XRE family  38.36 
 
 		 84 aa  40.8  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0447  transcriptional regulator, XRE family  32.35 
 
 		 139 aa  40.4  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0752  transcriptional regulator, XRE family  45.45 
 
 		 102 aa  40.4  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.596173  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>