39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4392 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  696    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  33.46 
 
 		 306 aa  138  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  35.71 
 
 		 397 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  29.17 
 
 		 342 aa  99  9e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  29.15 
 
 		 353 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  29.15 
 
 		 353 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  26.98 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  26.98 
 
 		 378 aa  85.1  0.000000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  31.02 
 
 		 357 aa  82  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  28 
 
 		 357 aa  81.6  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  24.74 
 
 		 433 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  31.77 
 
 		 356 aa  80.1  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0204  hypothetical protein  36.36 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571253 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  31.63 
 
 		 497 aa  72.8  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  31.63 
 
 		 497 aa  72.8  0.000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  32.08 
 
 		 342 aa  70.5  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  27.54 
 
 		 366 aa  69.7  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  31.89 
 
 		 472 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  31.89 
 
 		 472 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  41.57 
 
 		 331 aa  65.1  0.000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5215  hypothetical protein  26.67 
 
 		 261 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5059  hypothetical protein  26.49 
 
 		 268 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3153  hypothetical protein  26.67 
 
 		 261 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  34.12 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  26.96 
 
 		 307 aa  55.8  0.0000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  25.38 
 
 		 568 aa  55.8  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  34.52 
 
 		 410 aa  53.1  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3573  hypothetical protein  26.19 
 
 		 664 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0309383 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5415  hypothetical protein  26.9 
 
 		 849 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5593  hypothetical protein  26.9 
 
 		 849 aa  49.7  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0498  hypothetical protein  32.48 
 
 		 269 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167993  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0545  hypothetical protein  31.53 
 
 		 495 aa  47.4  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3098  transcriptional regulator, XRE family  26.63 
 
 		 158 aa  47  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5413  hypothetical protein  27.65 
 
 		 250 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5595  hypothetical protein  27.65 
 
 		 250 aa  46.2  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  27.38 
 
 		 433 aa  45.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3570  hypothetical protein  24.73 
 
 		 405 aa  44.7  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632914 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  35.29 
 
 		 183 aa  43.5  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  28.95 
 
 		 438 aa  43.1  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>