49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0217 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  100 
 
 		 433 aa  885    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  28.99 
 
 		 397 aa  153  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  28.46 
 
 		 378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  28.46 
 
 		 378 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  24.93 
 
 		 366 aa  125  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  29.95 
 
 		 342 aa  92.8  1e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  26 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  26 
 
 		 353 aa  87  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  28.19 
 
 		 356 aa  84.7  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  24.74 
 
 		 344 aa  81.6  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  27.01 
 
 		 357 aa  80.5  0.00000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  25 
 
 		 357 aa  77.8  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  23.31 
 
 		 342 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  23.37 
 
 		 331 aa  72  0.00000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  39.19 
 
 		 307 aa  67  0.0000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  22.49 
 
 		 497 aa  60.1  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  22.49 
 
 		 497 aa  60.1  0.00000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  30.67 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  22.22 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  22.22 
 
 		 472 aa  57.4  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  33.78 
 
 		 605 aa  57  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3573  hypothetical protein  20.05 
 
 		 664 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0309383 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  36.92 
 
 		 410 aa  55.1  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  28.57 
 
 		 628 aa  54.3  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  27.17 
 
 		 568 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5593  hypothetical protein  21.76 
 
 		 849 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5415  hypothetical protein  21.76 
 
 		 849 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  30 
 
 		 504 aa  52  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  31.87 
 
 		 183 aa  52.4  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  26.74 
 
 		 638 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  26.74 
 
 		 638 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  26.74 
 
 		 638 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  26.74 
 
 		 638 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0204  hypothetical protein  20.58 
 
 		 368 aa  50.8  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5059  hypothetical protein  29.46 
 
 		 268 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5215  hypothetical protein  29.46 
 
 		 261 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3153  hypothetical protein  29.46 
 
 		 261 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0375  hypothetical protein  36.78 
 
 		 488 aa  50.1  0.00008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4722  hypothetical protein  41.86 
 
 		 694 aa  49.3  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224738  normal  0.0942649 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  33.85 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  40.43 
 
 		 363 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2605  hypothetical protein  25 
 
 		 661 aa  47  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  40.43 
 
 		 313 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  40.43 
 
 		 313 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  23.21 
 
 		 563 aa  45.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4715  hypothetical protein  32.2 
 
 		 176 aa  45.8  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  31.25 
 
 		 455 aa  43.9  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  25 
 
 		 425 aa  43.5  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1705  hypothetical protein  38.3 
 
 		 193 aa  43.1  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.614952 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>