31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1682 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  717    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  100 
 
 		 353 aa  717    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  75.42 
 
 		 357 aa  545  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  74.29 
 
 		 357 aa  531  1e-150  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  72.8 
 
 		 356 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  35.76 
 
 		 342 aa  194  2e-48  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  36.89 
 
 		 397 aa  125  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  35.35 
 
 		 366 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  29.15 
 
 		 344 aa  89.4  1e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  26 
 
 		 433 aa  87  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  37.5 
 
 		 307 aa  84.3  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  36.77 
 
 		 342 aa  79.7  0.00000000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  36.77 
 
 		 331 aa  79.7  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  28.35 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  28.35 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0204  hypothetical protein  36.56 
 
 		 368 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571253 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  29.05 
 
 		 306 aa  72.4  0.00000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  31.05 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  31.05 
 
 		 497 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  31.52 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  31.52 
 
 		 472 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  25 
 
 		 568 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  26.75 
 
 		 183 aa  55.8  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  29.87 
 
 		 455 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  36.11 
 
 		 363 aa  45.4  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  35.06 
 
 		 504 aa  45.1  0.002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  36.11 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  36.11 
 
 		 313 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3577  TniQ family protein  28.57 
 
 		 407 aa  44.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0706835  hitchhiker  0.00685617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  25.48 
 
 		 432 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  25.48 
 
 		 432 aa  43.1  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>