44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1578 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  728    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  75.63 
 
 		 357 aa  550  1e-155  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  73.67 
 
 		 357 aa  543  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  72.8 
 
 		 353 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  72.8 
 
 		 353 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  33.96 
 
 		 342 aa  175  9.999999999999999e-43  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  35.64 
 
 		 397 aa  120  3e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  35.29 
 
 		 366 aa  120  3e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  28.81 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  28.81 
 
 		 378 aa  89  1e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  38.82 
 
 		 342 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  38.82 
 
 		 331 aa  88.2  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  28.19 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  31.77 
 
 		 344 aa  80.1  0.00000000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0204  hypothetical protein  35 
 
 		 368 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571253 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  34.15 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  28.12 
 
 		 306 aa  72.8  0.000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  30 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  30 
 
 		 497 aa  64.7  0.000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  26.11 
 
 		 568 aa  64.3  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  30.43 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  30.43 
 
 		 472 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5059  hypothetical protein  27.15 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3153  hypothetical protein  27.15 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5215  hypothetical protein  27.15 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.197637 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  25.32 
 
 		 183 aa  52.8  0.000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5415  hypothetical protein  29.3 
 
 		 849 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590405  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5593  hypothetical protein  29.3 
 
 		 849 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  48.78 
 
 		 455 aa  47.4  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  22.97 
 
 		 425 aa  46.6  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  25.77 
 
 		 504 aa  46.2  0.0008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  26.83 
 
 		 432 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  36.11 
 
 		 363 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3577  TniQ family protein  29 
 
 		 407 aa  45.8  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0706835  hitchhiker  0.00685617 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  26.83 
 
 		 432 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0498  hypothetical protein  30.86 
 
 		 269 aa  46.2  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.167993  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  36.11 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  36.11 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4715  hypothetical protein  34.92 
 
 		 176 aa  44.7  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  27 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  34.92 
 
 		 410 aa  44.7  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3875  hypothetical protein  26.39 
 
 		 476 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5595  hypothetical protein  28.9 
 
 		 250 aa  42.7  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5413  hypothetical protein  28.9 
 
 		 250 aa  42.7  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526467  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>