34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_3152 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  643    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  100 
 
 		 313 aa  643    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  631  1e-180  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  23.51 
 
 		 628 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3363  hypothetical protein  23.64 
 
 		 329 aa  62.4  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  22.05 
 
 		 410 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  45.61 
 
 		 342 aa  57.4  0.0000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  23.08 
 
 		 410 aa  57.4  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0027  hypothetical protein  27.59 
 
 		 597 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6545  hypothetical protein  24.62 
 
 		 322 aa  54.3  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0018  hypothetical protein  36.76 
 
 		 605 aa  53.1  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4722  hypothetical protein  33.33 
 
 		 694 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224738  normal  0.0942649 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1857  hypothetical protein  31.52 
 
 		 504 aa  50.4  0.00004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  29.27 
 
 		 357 aa  48.9  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2522  hypothetical protein  28.46 
 
 		 357 aa  48.1  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.716097  normal  0.197177 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  38.57 
 
 		 366 aa  47.8  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  43.18 
 
 		 432 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  43.18 
 
 		 432 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  38.46 
 
 		 433 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  40.43 
 
 		 433 aa  47.4  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2605  hypothetical protein  26.19 
 
 		 661 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.250599  normal  0.12756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  36.11 
 
 		 356 aa  46.2  0.0007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  38.03 
 
 		 455 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  36.11 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  36.11 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06982  hypothetical protein  29.58 
 
 		 183 aa  45.1  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2451  hypothetical protein  25.34 
 
 		 299 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.557774  hitchhiker  0.0000994908 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  45.95 
 
 		 638 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  45.95 
 
 		 638 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  45.95 
 
 		 638 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  27.01 
 
 		 306 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  45.95 
 
 		 638 aa  43.5  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  35.62 
 
 		 397 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0375  hypothetical protein  35.71 
 
 		 488 aa  42.7  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>