32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4575 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  884    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  884    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  51.06 
 
 		 438 aa  430  1e-119  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  47.92 
 
 		 433 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  40.38 
 
 		 425 aa  301  2e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1651  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 463 aa  127  3e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2450  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 463 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3875  hypothetical protein  26.17 
 
 		 476 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5417  hypothetical protein  22.17 
 
 		 471 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1657  hypothetical protein  27.92 
 
 		 329 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0210  hypothetical protein  25.4 
 
 		 480 aa  87.4  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  25.19 
 
 		 455 aa  86.3  9e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2897  hypothetical protein  25 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3570  hypothetical protein  25.91 
 
 		 405 aa  77  0.0000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0545  hypothetical protein  23.45 
 
 		 495 aa  68.2  0.0000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2451  hypothetical protein  28 
 
 		 299 aa  67.4  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.557774  hitchhiker  0.0000994908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4432  hypothetical protein  25 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.541212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0076  hypothetical protein  29.94 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.230149 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1036  hypothetical protein  21.43 
 
 		 449 aa  51.6  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2604  hypothetical protein  28.88 
 
 		 609 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5058  hypothetical protein  43.18 
 
 		 363 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.863034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5216  hypothetical protein  43.18 
 
 		 313 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.204329 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3152  hypothetical protein  43.18 
 
 		 313 aa  47.4  0.0005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  25.14 
 
 		 306 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  32.35 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  32.35 
 
 		 378 aa  46.2  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  26.83 
 
 		 356 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4581  hypothetical protein  40 
 
 		 389 aa  44.7  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4978  hypothetical protein  24.39 
 
 		 357 aa  43.9  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00760749 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  29.13 
 
 		 366 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1682  hypothetical protein  25.48 
 
 		 353 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2934  hypothetical protein  25.48 
 
 		 353 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.229686  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>