18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0545 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_0545  hypothetical protein  100 
 
 		 495 aa  1013    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  31.78 
 
 		 455 aa  210  5e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  22.17 
 
 		 425 aa  73.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1651  TetR family transcriptional regulator  21.04 
 
 		 463 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2450  TetR family transcriptional regulator  23.25 
 
 		 463 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5417  hypothetical protein  30 
 
 		 471 aa  68.2  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  23.45 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  23.45 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1657  hypothetical protein  29.94 
 
 		 329 aa  67  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  23.73 
 
 		 433 aa  66.6  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  22.03 
 
 		 438 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2451  hypothetical protein  26.9 
 
 		 299 aa  59.3  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.557774  hitchhiker  0.0000994908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3875  hypothetical protein  26.09 
 
 		 476 aa  57  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  28.92 
 
 		 331 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  29.17 
 
 		 342 aa  49.7  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  31.53 
 
 		 344 aa  47.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3570  hypothetical protein  36.23 
 
 		 405 aa  45.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4432  hypothetical protein  24.16 
 
 		 434 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.541212  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>