20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3570 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3570  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  833    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632914 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  26.91 
 
 		 425 aa  78.6  0.0000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  25.91 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  25.91 
 
 		 432 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  26.2 
 
 		 433 aa  76.3  0.0000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2450  TetR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 463 aa  73.6  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  32.16 
 
 		 438 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1651  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 463 aa  72.4  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5417  hypothetical protein  23.44 
 
 		 471 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1657  hypothetical protein  25.94 
 
 		 329 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2451  hypothetical protein  27.14 
 
 		 299 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.557774  hitchhiker  0.0000994908 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3875  hypothetical protein  31.71 
 
 		 476 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4432  hypothetical protein  30.53 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.541212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0210  hypothetical protein  29.03 
 
 		 480 aa  47  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2897  hypothetical protein  28.95 
 
 		 460 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  36.62 
 
 		 397 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  21.67 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  21.67 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4392  hypothetical protein  24.73 
 
 		 344 aa  44.7  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.537919  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0545  hypothetical protein  36.23 
 
 		 495 aa  45.1  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>