40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_4742 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  100 
 
 
438 aa  898    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  51.06 
 
 
432 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  51.06 
 
 
432 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  46.73 
 
 
433 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  40.19 
 
 
425 aa  300  5e-80  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5417  hypothetical protein  23.81 
 
 
471 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1651  TetR family transcriptional regulator  27.11 
 
 
463 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2450  TetR family transcriptional regulator  27.62 
 
 
463 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1657  hypothetical protein  30.34 
 
 
329 aa  87.4  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3875  hypothetical protein  26.26 
 
 
476 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0210  hypothetical protein  25.06 
 
 
480 aa  84.7  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2897  hypothetical protein  24.81 
 
 
460 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  25.71 
 
 
455 aa  77.4  0.0000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2451  hypothetical protein  26.91 
 
 
299 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.557774  hitchhiker  0.0000994908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3570  hypothetical protein  32.16 
 
 
405 aa  72.8  0.00000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.632914 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4432  hypothetical protein  23.13 
 
 
434 aa  62.4  0.00000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.541212  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0545  hypothetical protein  22.03 
 
 
495 aa  59.7  0.00000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0076  hypothetical protein  30.22 
 
 
199 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.230149 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  45.1 
 
 
342 aa  52  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  40.54 
 
 
397 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1036  hypothetical protein  21.59 
 
 
449 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5595  hypothetical protein  39.34 
 
 
250 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0880  hypothetical protein  29.92 
 
 
568 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.889726  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5413  hypothetical protein  39.34 
 
 
250 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.526467  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  30.12 
 
 
366 aa  48.9  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2604  hypothetical protein  28.67 
 
 
609 aa  47.8  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  24.8 
 
 
410 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  42.55 
 
 
378 aa  47  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  42.55 
 
 
378 aa  47  0.0007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  32.46 
 
 
638 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  32.46 
 
 
638 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  32.46 
 
 
638 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  32.46 
 
 
638 aa  46.6  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0884  hypothetical protein  28.06 
 
 
556 aa  45.1  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3573  hypothetical protein  38.46 
 
 
664 aa  45.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0309383 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  37.31 
 
 
497 aa  43.5  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  37.31 
 
 
497 aa  43.5  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  37.31 
 
 
472 aa  43.5  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  37.31 
 
 
472 aa  43.5  0.007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  29.51 
 
 
569 aa  43.5  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>