15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4432 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007948  Bpro_4432  hypothetical protein  100 
 
 
434 aa  896    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.541212  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1651  TetR family transcriptional regulator  21.7 
 
 
463 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2450  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 
463 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  24.76 
 
 
433 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  25 
 
 
432 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  25 
 
 
432 aa  65.5  0.000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  23.83 
 
 
425 aa  63.5  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5417  hypothetical protein  20 
 
 
471 aa  63.9  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2451  hypothetical protein  26.87 
 
 
299 aa  63.5  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.557774  hitchhiker  0.0000994908 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  23.13 
 
 
438 aa  62.4  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0210  hypothetical protein  21.99 
 
 
480 aa  57  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1657  hypothetical protein  24.18 
 
 
329 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2897  hypothetical protein  21.38 
 
 
460 aa  54.3  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3570  hypothetical protein  30.53 
 
 
405 aa  54.3  0.000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.632914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0545  hypothetical protein  24.16 
 
 
495 aa  44.3  0.004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>