18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0210 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2897  hypothetical protein  99.78 
 
 
460 aa  942    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0210  hypothetical protein  100 
 
 
480 aa  985    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3875  hypothetical protein  39.14 
 
 
476 aa  288  2e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0076  hypothetical protein  48.36 
 
 
199 aa  187  5e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.230149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0062  hypothetical protein  47.18 
 
 
231 aa  167  5e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.713736 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  27.68 
 
 
433 aa  102  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1651  TetR family transcriptional regulator  23.21 
 
 
463 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2450  TetR family transcriptional regulator  24.76 
 
 
463 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  25.4 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  25.4 
 
 
432 aa  87.4  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  25.06 
 
 
438 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  23.74 
 
 
425 aa  82  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1657  hypothetical protein  28.93 
 
 
329 aa  73.2  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4432  hypothetical protein  21.99 
 
 
434 aa  56.6  0.000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.541212  normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5417  hypothetical protein  21.97 
 
 
471 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  22.71 
 
 
455 aa  52.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2451  hypothetical protein  23.21 
 
 
299 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.557774  hitchhiker  0.0000994908 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3570  hypothetical protein  27.74 
 
 
405 aa  46.6  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.632914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>