19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_3875 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3875  hypothetical protein  100 
 
 		 476 aa  974    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0210  hypothetical protein  40.8 
 
 		 480 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2897  hypothetical protein  38.93 
 
 		 460 aa  258  2e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0076  hypothetical protein  39.02 
 
 		 199 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.230149 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0062  hypothetical protein  40.72 
 
 		 231 aa  114  5e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.713736 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  26.17 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  26.17 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1651  TetR family transcriptional regulator  25.06 
 
 		 463 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2450  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 463 aa  93.6  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1657  hypothetical protein  31.07 
 
 		 329 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  26.26 
 
 		 438 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  27.25 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  23.84 
 
 		 425 aa  80.5  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2451  hypothetical protein  26.32 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.557774  hitchhiker  0.0000994908 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5417  hypothetical protein  28.48 
 
 		 471 aa  65.9  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3570  hypothetical protein  31.71 
 
 		 405 aa  58.2  0.0000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0545  hypothetical protein  26.09 
 
 		 495 aa  57  0.0000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  23.58 
 
 		 455 aa  55.1  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  26.39 
 
 		 356 aa  43.5  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>