49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_3186 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  873    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3502  hypothetical protein  40.38 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4575  hypothetical protein  40.38 
 
 		 432 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  40.19 
 
 		 438 aa  300  4e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4717  hypothetical protein  41.99 
 
 		 433 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00256772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1651  TetR family transcriptional regulator  25.56 
 
 		 463 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5417  hypothetical protein  25.08 
 
 		 471 aa  98.2  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1657  hypothetical protein  33.78 
 
 		 329 aa  97.1  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2450  TetR family transcriptional regulator  24.94 
 
 		 463 aa  94  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.380494  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0210  hypothetical protein  23.74 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3875  hypothetical protein  23.84 
 
 		 476 aa  80.5  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3570  hypothetical protein  26.91 
 
 		 405 aa  78.6  0.0000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.632914 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2897  hypothetical protein  23 
 
 		 460 aa  75.5  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0545  hypothetical protein  22.17 
 
 		 495 aa  73.9  0.000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0542  hypothetical protein  26.1 
 
 		 455 aa  66.6  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2451  hypothetical protein  29.67 
 
 		 299 aa  64.7  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.557774  hitchhiker  0.0000994908 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4432  hypothetical protein  23.83 
 
 		 434 aa  63.5  0.000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.541212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3049  hypothetical protein  42.86 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.356075 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  45.61 
 
 		 569 aa  56.2  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4581  hypothetical protein  27.22 
 
 		 389 aa  55.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0076  hypothetical protein  26.57 
 
 		 199 aa  54.7  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.230149 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  25.39 
 
 		 342 aa  52.8  0.00001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  35.23 
 
 		 410 aa  50.1  0.00007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5408  hypothetical protein  32.48 
 
 		 393 aa  50.1  0.00007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3855  hypothetical protein  34.78 
 
 		 410 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0189615 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2646  hypothetical protein  30.51 
 
 		 497 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.676397  normal  0.0791481 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1036  hypothetical protein  22.59 
 
 		 449 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.276879  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1224  hypothetical protein  30.68 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2173  hypothetical protein  30.51 
 
 		 497 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0687306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1348  hypothetical protein  30.68 
 
 		 472 aa  48.5  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4722  hypothetical protein  28.41 
 
 		 694 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.224738  normal  0.0942649 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2128  hypothetical protein  33.01 
 
 		 331 aa  47.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.0161775 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  28.43 
 
 		 610 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2503  hypothetical protein  33.01 
 
 		 342 aa  47.4  0.0005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0189  hypothetical protein  30.77 
 
 		 307 aa  47  0.0006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1578  hypothetical protein  22.97 
 
 		 356 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.223334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  31.25 
 
 		 563 aa  45.8  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  37.5 
 
 		 366 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1592  hypothetical protein  32.08 
 
 		 378 aa  44.3  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.350355  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0695  hypothetical protein  32.08 
 
 		 378 aa  44.3  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.513596  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  25 
 
 		 433 aa  43.5  0.008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  32.56 
 
 		 617 aa  43.5  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0008  hypothetical protein  28.7 
 
 		 638 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0016  hypothetical protein  28.7 
 
 		 638 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.490672  unclonable  0.000000381885 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  32.65 
 
 		 306 aa  43.1  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2604  hypothetical protein  45.45 
 
 		 609 aa  43.1  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.276166  normal  0.470384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0008  hypothetical protein  28.7 
 
 		 638 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0559853  normal  0.0972457 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0010  hypothetical protein  28.7 
 
 		 638 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610647  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0204  hypothetical protein  35.71 
 
 		 368 aa  43.1  0.01  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000571253 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>