39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0178 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  100 
 
 		 610 aa  1246    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  31.48 
 
 		 636 aa  310  5e-83  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  33.28 
 
 		 628 aa  308  1.0000000000000001e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  32.74 
 
 		 616 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  31.83 
 
 		 625 aa  273  5.000000000000001e-72  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  27.06 
 
 		 609 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  27.06 
 
 		 609 aa  249  1e-64  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  27.06 
 
 		 609 aa  244  3.9999999999999997e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  30.74 
 
 		 582 aa  241  4e-62  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  28.32 
 
 		 630 aa  220  6e-56  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  25.96 
 
 		 597 aa  204  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  25.41 
 
 		 617 aa  154  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  27.25 
 
 		 579 aa  134  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  22.99 
 
 		 571 aa  132  3e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  27.1 
 
 		 316 aa  110  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  22.94 
 
 		 569 aa  109  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  26.56 
 
 		 533 aa  108  3e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  27.68 
 
 		 295 aa  102  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  26.64 
 
 		 280 aa  99.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  23.02 
 
 		 591 aa  95.5  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  26.69 
 
 		 505 aa  92.8  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  23.95 
 
 		 435 aa  91.7  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  24.57 
 
 		 514 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  25.24 
 
 		 301 aa  78.2  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  23.93 
 
 		 338 aa  77.4  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  23.02 
 
 		 503 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  28.66 
 
 		 489 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  25.14 
 
 		 477 aa  63.5  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  21.67 
 
 		 563 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  25.25 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  25 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  19.05 
 
 		 515 aa  55.1  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  27.92 
 
 		 535 aa  51.6  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  21.64 
 
 		 561 aa  51.2  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  31.43 
 
 		 569 aa  49.3  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  28.43 
 
 		 425 aa  47.8  0.0006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  23.95 
 
 		 361 aa  46.2  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  23.66 
 
 		 523 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  29 
 
 		 462 aa  44.3  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>