40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0248 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  100 
 
 
630 aa  1306    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  36.42 
 
 
628 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  33.81 
 
 
636 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  36.03 
 
 
582 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  33.92 
 
 
616 aa  338  1.9999999999999998e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  30.87 
 
 
597 aa  285  2.0000000000000002e-75  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  28.57 
 
 
625 aa  251  3e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  28.55 
 
 
609 aa  237  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  28.55 
 
 
609 aa  237  4e-61  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  28.39 
 
 
609 aa  226  1e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  28.32 
 
 
610 aa  220  6e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  32.36 
 
 
533 aa  163  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  25 
 
 
579 aa  152  2e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  25.43 
 
 
617 aa  137  8e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  23.47 
 
 
591 aa  118  3e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  29.13 
 
 
505 aa  113  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  25.66 
 
 
500 aa  97.4  6e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  33.33 
 
 
489 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  25.55 
 
 
316 aa  95.9  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  26.95 
 
 
569 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  26.27 
 
 
563 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  21.73 
 
 
571 aa  92.8  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  34.18 
 
 
295 aa  90.9  7e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  23.2 
 
 
503 aa  89  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  33.12 
 
 
280 aa  88.2  4e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  29.67 
 
 
514 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  30.87 
 
 
532 aa  78.2  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  25.16 
 
 
561 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  25.57 
 
 
515 aa  76.3  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  22.25 
 
 
435 aa  71.6  0.00000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  21.43 
 
 
338 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  22.71 
 
 
563 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  27.56 
 
 
361 aa  56.6  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  25 
 
 
301 aa  55.8  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  26.85 
 
 
523 aa  53.9  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  23.34 
 
 
462 aa  52.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  19.96 
 
 
477 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3106  transposon Tn7 transposition protein D  27.78 
 
 
300 aa  51.6  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0387567 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  27.74 
 
 
535 aa  51.6  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  23.72 
 
 
569 aa  48.1  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>