43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1871 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  100 
 
 		 625 aa  1297    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  43.06 
 
 		 628 aa  529  1e-149  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  38.82 
 
 		 636 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  31.26 
 
 		 616 aa  299  1e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  31.25 
 
 		 582 aa  286  5e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  31.83 
 
 		 610 aa  273  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  28.57 
 
 		 630 aa  251  3e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  28.67 
 
 		 597 aa  251  4e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  28.24 
 
 		 609 aa  242  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  28.24 
 
 		 609 aa  242  2e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  28.43 
 
 		 609 aa  230  6e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  29.14 
 
 		 579 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  32.59 
 
 		 316 aa  170  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  31.25 
 
 		 533 aa  167  6.9999999999999995e-40  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  23.84 
 
 		 617 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  36.65 
 
 		 280 aa  140  7e-32  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  35.6 
 
 		 295 aa  139  1e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  27.85 
 
 		 514 aa  127  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  27.4 
 
 		 505 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  27.74 
 
 		 500 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  25.56 
 
 		 569 aa  114  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  22.4 
 
 		 591 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  26.89 
 
 		 503 aa  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  23.15 
 
 		 571 aa  108  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  25.18 
 
 		 489 aa  102  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  22.06 
 
 		 532 aa  90.5  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  28.83 
 
 		 515 aa  85.5  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  25.83 
 
 		 561 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  22.4 
 
 		 477 aa  85.1  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  22.55 
 
 		 435 aa  84.3  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  22.37 
 
 		 563 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  22.11 
 
 		 338 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  33.54 
 
 		 301 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  22.9 
 
 		 563 aa  70.5  0.00000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  22.12 
 
 		 535 aa  69.7  0.0000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  22.91 
 
 		 462 aa  61.6  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  30.85 
 
 		 523 aa  58.5  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0253  hypothetical protein  21.16 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  26.58 
 
 		 569 aa  55.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1214  hypothetical protein  26.63 
 
 		 495 aa  53.5  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  26.42 
 
 		 361 aa  51.2  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0254  hypothetical protein  43.59 
 
 		 585 aa  48.9  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5408  hypothetical protein  30.53 
 
 		 393 aa  45.4  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>