40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCE_0177 on replicon NC_003909
Organism: Bacillus cereus ATCC 10987



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  100 
 
 
616 aa  1279    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  35.02 
 
 
636 aa  415  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  36.15 
 
 
628 aa  381  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  33.92 
 
 
630 aa  338  1.9999999999999998e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  35.12 
 
 
582 aa  336  9e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  32.74 
 
 
610 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  31.26 
 
 
625 aa  299  1e-79  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  30.05 
 
 
597 aa  280  8e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  29.37 
 
 
609 aa  260  6e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  29.37 
 
 
609 aa  260  6e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  28.82 
 
 
609 aa  255  2.0000000000000002e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  27.08 
 
 
617 aa  161  3e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  26.29 
 
 
579 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  28.34 
 
 
533 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  37.78 
 
 
295 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  29.64 
 
 
505 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  27.3 
 
 
316 aa  110  7.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  35.36 
 
 
280 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  24.4 
 
 
503 aa  98.6  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  23.01 
 
 
571 aa  97.4  8e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  22.11 
 
 
591 aa  89.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  25 
 
 
514 aa  87.4  6e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  24.34 
 
 
500 aa  87.4  8e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  20.64 
 
 
532 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  25.08 
 
 
338 aa  79  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  31.55 
 
 
515 aa  77  0.0000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  21.34 
 
 
489 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  26.06 
 
 
563 aa  74.7  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  22.98 
 
 
569 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  24.23 
 
 
477 aa  63.5  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  25.75 
 
 
561 aa  62  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  27.12 
 
 
523 aa  58.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  23.78 
 
 
563 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  22.76 
 
 
301 aa  54.7  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  21.89 
 
 
435 aa  53.5  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  23.42 
 
 
361 aa  51.2  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  25.97 
 
 
535 aa  50.4  0.00009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0253  hypothetical protein  25.25 
 
 
470 aa  49.7  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1214  hypothetical protein  26.24 
 
 
495 aa  43.9  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  23.81 
 
 
569 aa  43.9  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>