40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1204 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  93.43 
 
 		 609 aa  1116    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  100 
 
 		 609 aa  1243    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  93.43 
 
 		 609 aa  1116    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  33.49 
 
 		 636 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  31.78 
 
 		 628 aa  333  7.000000000000001e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  30.54 
 
 		 582 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  28.82 
 
 		 616 aa  266  1e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  27.06 
 
 		 610 aa  243  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  28.43 
 
 		 625 aa  242  1e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  28.66 
 
 		 630 aa  242  1e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  29.55 
 
 		 597 aa  222  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  34.12 
 
 		 505 aa  158  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  34.98 
 
 		 533 aa  157  5.0000000000000005e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  30.87 
 
 		 514 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  25.16 
 
 		 617 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  30.64 
 
 		 503 aa  120  6e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  35.68 
 
 		 295 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  27.76 
 
 		 500 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  35.48 
 
 		 280 aa  110  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  23.69 
 
 		 579 aa  110  8.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  29.74 
 
 		 591 aa  107  7e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  32.43 
 
 		 316 aa  105  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  23.86 
 
 		 571 aa  100  7e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  26.91 
 
 		 489 aa  95.1  4e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  24.59 
 
 		 515 aa  93.2  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  26.58 
 
 		 435 aa  88.2  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  26.6 
 
 		 338 aa  88.2  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  24.92 
 
 		 569 aa  84.3  0.000000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  21.53 
 
 		 532 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  28.83 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  27.13 
 
 		 462 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  29.56 
 
 		 563 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  23.98 
 
 		 477 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  25.75 
 
 		 563 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  28.08 
 
 		 535 aa  53.9  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  29.65 
 
 		 569 aa  52.4  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  28.12 
 
 		 361 aa  51.6  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  25.3 
 
 		 523 aa  49.3  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  24.85 
 
 		 301 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1214  hypothetical protein  24.52 
 
 		 495 aa  45.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>