42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5721 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  100 
 
 		 561 aa  1167    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  45.54 
 
 		 563 aa  535  1e-151  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  32.92 
 
 		 563 aa  280  3e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  25.48 
 
 		 533 aa  127  4.0000000000000003e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  27.64 
 
 		 636 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  28.2 
 
 		 628 aa  102  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  32.48 
 
 		 295 aa  97.1  8e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  26.32 
 
 		 582 aa  94.7  4e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  31.61 
 
 		 280 aa  89.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  30.91 
 
 		 316 aa  89.4  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  33.12 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  25.83 
 
 		 625 aa  84.7  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  27.46 
 
 		 569 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  25.16 
 
 		 630 aa  75.9  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  32.86 
 
 		 597 aa  75.9  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  30.14 
 
 		 569 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  22.16 
 
 		 591 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  27.11 
 
 		 609 aa  69.7  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  27.61 
 
 		 609 aa  67.8  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  27.61 
 
 		 609 aa  67.8  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  31.06 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  25.97 
 
 		 503 aa  63.9  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  25.42 
 
 		 477 aa  63.2  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  25.75 
 
 		 616 aa  62  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  23.57 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  25.11 
 
 		 338 aa  54.7  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  26.55 
 
 		 301 aa  53.9  0.000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  20.68 
 
 		 579 aa  53.1  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  26.44 
 
 		 515 aa  52.8  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1214  hypothetical protein  26.32 
 
 		 495 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  20.96 
 
 		 514 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0254  hypothetical protein  29.79 
 
 		 585 aa  51.6  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  21.64 
 
 		 610 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  26.58 
 
 		 361 aa  50.8  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5408  hypothetical protein  38.46 
 
 		 393 aa  50.4  0.00008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  24.54 
 
 		 505 aa  50.4  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  26.25 
 
 		 617 aa  49.3  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  22.52 
 
 		 462 aa  47.8  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  26.96 
 
 		 523 aa  47  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  23.78 
 
 		 535 aa  45.8  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5191  hypothetical protein  38.78 
 
 		 366 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.909209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  22.09 
 
 		 435 aa  43.9  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>