43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2324 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  83.39 
 
 		 280 aa  488  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  38.46 
 
 		 316 aa  209  3e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  32.09 
 
 		 628 aa  166  5e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  44.02 
 
 		 636 aa  152  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  44.79 
 
 		 582 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  35.6 
 
 		 625 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  34.3 
 
 		 533 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  37.78 
 
 		 616 aa  112  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  34.95 
 
 		 609 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  34.95 
 
 		 609 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  34.59 
 
 		 609 aa  105  1e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  27.68 
 
 		 610 aa  102  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  34.16 
 
 		 569 aa  100  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  32.48 
 
 		 561 aa  97.1  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  33.52 
 
 		 514 aa  96.7  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  33.12 
 
 		 563 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  33.33 
 
 		 489 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  34.18 
 
 		 630 aa  90.9  3e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  32.61 
 
 		 505 aa  90.5  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  28.49 
 
 		 301 aa  84  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  29.35 
 
 		 532 aa  80.9  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  33.58 
 
 		 597 aa  80.1  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  31.52 
 
 		 563 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  32.73 
 
 		 591 aa  79  0.00000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  29.03 
 
 		 503 aa  77  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  26.52 
 
 		 500 aa  76.6  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  29.27 
 
 		 617 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  26.44 
 
 		 571 aa  70.5  0.00000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  28.26 
 
 		 569 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  26.21 
 
 		 338 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  25.32 
 
 		 515 aa  63.9  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  25.44 
 
 		 435 aa  58.9  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  32.32 
 
 		 579 aa  58.9  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  29.03 
 
 		 535 aa  58.2  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  29.03 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  27.98 
 
 		 361 aa  57.4  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  20.82 
 
 		 462 aa  54.7  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  25.83 
 
 		 523 aa  50.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1214  hypothetical protein  30.77 
 
 		 495 aa  46.6  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5408  hypothetical protein  26.75 
 
 		 393 aa  45.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0254  hypothetical protein  23.36 
 
 		 585 aa  43.9  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3106  transposon Tn7 transposition protein D  35 
 
 		 300 aa  43.5  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0387567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>