40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_5407 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  100 
 
 		 532 aa  1105    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  26.48 
 
 		 523 aa  185  2.0000000000000003e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  25.28 
 
 		 636 aa  140  6e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  26.01 
 
 		 591 aa  123  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  24.77 
 
 		 628 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  23.98 
 
 		 533 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  26.72 
 
 		 569 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  27.39 
 
 		 582 aa  108  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  24.09 
 
 		 597 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  22.57 
 
 		 625 aa  94.7  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  21.72 
 
 		 616 aa  90.9  5e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  21.94 
 
 		 609 aa  86.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  21.94 
 
 		 609 aa  86.7  0.000000000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  24.77 
 
 		 477 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  26.27 
 
 		 489 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  26.38 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  26.38 
 
 		 280 aa  80.1  0.00000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  22.24 
 
 		 609 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  30.87 
 
 		 630 aa  78.6  0.0000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  26.23 
 
 		 503 aa  72  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  28.48 
 
 		 500 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  29.56 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  31.25 
 
 		 563 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  19.1 
 
 		 579 aa  65.9  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  31.06 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  32.05 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  25.32 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  28.83 
 
 		 515 aa  59.7  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  26.98 
 
 		 316 aa  60.1  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  28.3 
 
 		 435 aa  57  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  27.44 
 
 		 301 aa  54.3  0.000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  20.65 
 
 		 535 aa  53.1  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  29.61 
 
 		 617 aa  52.4  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  30.67 
 
 		 571 aa  50.1  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0254  hypothetical protein  26.17 
 
 		 585 aa  49.3  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  23.6 
 
 		 514 aa  48.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3106  transposon Tn7 transposition protein D  28.65 
 
 		 300 aa  46.6  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0387567 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0253  hypothetical protein  31.19 
 
 		 470 aa  45.8  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  26.01 
 
 		 462 aa  45.1  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  21.94 
 
 		 610 aa  43.9  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>