39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_3489 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  100 
 
 
316 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  39.87 
 
 
636 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  38.46 
 
 
295 aa  209  3e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  37.54 
 
 
280 aa  194  1e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  36.36 
 
 
628 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  32.59 
 
 
625 aa  170  3e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  33.96 
 
 
582 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  30.53 
 
 
533 aa  140  3e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  27.3 
 
 
616 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  27.1 
 
 
610 aa  110  3e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  34.04 
 
 
609 aa  106  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  34.04 
 
 
609 aa  106  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  33.33 
 
 
609 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  25.55 
 
 
630 aa  95.9  8e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  35.4 
 
 
489 aa  91.7  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  35.2 
 
 
591 aa  91.7  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  30.91 
 
 
561 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  25.08 
 
 
563 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  31.25 
 
 
569 aa  80.9  0.00000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  30.39 
 
 
500 aa  79.7  0.00000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  25.62 
 
 
597 aa  79.3  0.00000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  29.78 
 
 
514 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  29.09 
 
 
563 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  33.33 
 
 
505 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  25.15 
 
 
617 aa  72.8  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  23.47 
 
 
515 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  31.74 
 
 
301 aa  70.5  0.00000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  28.57 
 
 
503 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  28.79 
 
 
569 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  26.5 
 
 
579 aa  66.2  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  26.18 
 
 
571 aa  61.6  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  26.98 
 
 
532 aa  60.1  0.00000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0254  hypothetical protein  44.07 
 
 
585 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  23.74 
 
 
435 aa  57.8  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  30.33 
 
 
477 aa  57  0.0000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  26.14 
 
 
535 aa  53.9  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3106  transposon Tn7 transposition protein D  27.61 
 
 
300 aa  52.8  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0387567 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  27.67 
 
 
338 aa  47  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1214  hypothetical protein  25 
 
 
495 aa  47.4  0.0004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>