41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_3196 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  100 
 
 		 609 aa  1239    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  93.43 
 
 		 609 aa  1116    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  100 
 
 		 609 aa  1239    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  34.44 
 
 		 636 aa  354  2.9999999999999997e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  31.99 
 
 		 628 aa  339  9e-92  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  31.11 
 
 		 582 aa  281  2e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  29.37 
 
 		 616 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  29.13 
 
 		 630 aa  254  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  28.24 
 
 		 625 aa  254  4.0000000000000004e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  26.9 
 
 		 610 aa  248  2e-64  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  30.33 
 
 		 597 aa  239  1e-61  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  33.67 
 
 		 505 aa  162  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  34.98 
 
 		 533 aa  157  7e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  25.29 
 
 		 617 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  28.95 
 
 		 514 aa  139  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  31.31 
 
 		 503 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  23.85 
 
 		 579 aa  119  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  28.67 
 
 		 500 aa  118  3e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  34.95 
 
 		 295 aa  116  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  30.07 
 
 		 591 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  34.95 
 
 		 280 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  32.97 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  26.23 
 
 		 515 aa  107  7e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  23.72 
 
 		 571 aa  105  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  28.52 
 
 		 338 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  25.55 
 
 		 569 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  26.58 
 
 		 435 aa  92.4  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  32.93 
 
 		 489 aa  92  3e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  25.17 
 
 		 532 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  28.22 
 
 		 561 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  29.56 
 
 		 563 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  25.26 
 
 		 462 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  24.14 
 
 		 477 aa  61.2  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  26.79 
 
 		 563 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  27.63 
 
 		 535 aa  57  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  28.74 
 
 		 569 aa  53.9  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  28.21 
 
 		 361 aa  52.8  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  31.52 
 
 		 523 aa  49.7  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  21.51 
 
 		 301 aa  47.4  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1214  hypothetical protein  32.05 
 
 		 495 aa  46.2  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3106  transposon Tn7 transposition protein D  28.3 
 
 		 300 aa  44.3  0.008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0387567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>