41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7024 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  100 
 
 		 563 aa  1150    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  33.09 
 
 		 561 aa  292  9e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  33.51 
 
 		 563 aa  288  2e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  27.29 
 
 		 489 aa  100  6e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  26.28 
 
 		 628 aa  96.7  9e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  26.73 
 
 		 582 aa  95.5  2e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  24.62 
 
 		 636 aa  90.9  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  25.62 
 
 		 533 aa  84.3  0.000000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  25.08 
 
 		 316 aa  82.8  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  31.52 
 
 		 295 aa  80.9  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0254  hypothetical protein  27.49 
 
 		 585 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  23.97 
 
 		 630 aa  75.1  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  23.35 
 
 		 625 aa  73.9  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  28.22 
 
 		 280 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  40 
 
 		 569 aa  67.4  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  28.23 
 
 		 591 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  22.05 
 
 		 579 aa  62  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  22.76 
 
 		 597 aa  61.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  25 
 
 		 610 aa  60.8  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  32.05 
 
 		 532 aa  60.8  0.00000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5408  hypothetical protein  36.78 
 
 		 393 aa  60.1  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00712451 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  26.79 
 
 		 609 aa  57.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  20.19 
 
 		 616 aa  57.8  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  26.79 
 
 		 609 aa  57.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  24.87 
 
 		 477 aa  55.8  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  25.75 
 
 		 609 aa  55.1  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  28.42 
 
 		 569 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  26.45 
 
 		 301 aa  52.4  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  24 
 
 		 503 aa  52  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  23.12 
 
 		 535 aa  50.8  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5191  hypothetical protein  34.38 
 
 		 366 aa  50.8  0.00007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.909209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  26.83 
 
 		 435 aa  49.3  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  34 
 
 		 338 aa  48.5  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  24.28 
 
 		 515 aa  47.4  0.0008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  30.36 
 
 		 425 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0217  hypothetical protein  23.21 
 
 		 433 aa  45.1  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.289698  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0027  hypothetical protein  35.63 
 
 		 597 aa  45.4  0.003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  22.5 
 
 		 571 aa  45.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  22.16 
 
 		 361 aa  44.3  0.007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4187  hypothetical protein  25.3 
 
 		 410 aa  43.9  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0030  hypothetical protein  30.99 
 
 		 628 aa  43.5  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>