38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_5192 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  100 
 
 		 489 aa  1012    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  27.47 
 
 		 533 aa  152  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  30.84 
 
 		 636 aa  138  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  28.16 
 
 		 628 aa  129  9.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  29.91 
 
 		 569 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  35.67 
 
 		 582 aa  110  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  25.18 
 
 		 625 aa  102  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  36.25 
 
 		 591 aa  96.7  8e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  33.33 
 
 		 630 aa  96.7  9e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  33.33 
 
 		 295 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  35.4 
 
 		 316 aa  91.7  2e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  33.33 
 
 		 280 aa  91.7  3e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  23.47 
 
 		 505 aa  91.3  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  30.53 
 
 		 597 aa  90.5  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  23.42 
 
 		 514 aa  89  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  26.91 
 
 		 609 aa  87.8  4e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  30.34 
 
 		 503 aa  87  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  31.75 
 
 		 609 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  33.12 
 
 		 561 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  31.75 
 
 		 609 aa  85.1  0.000000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  26.21 
 
 		 532 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  30.07 
 
 		 563 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  33.33 
 
 		 563 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  22.24 
 
 		 515 aa  78.6  0.0000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  21.34 
 
 		 616 aa  76.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  28.66 
 
 		 610 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  26.22 
 
 		 500 aa  65.9  0.000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  28.85 
 
 		 617 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  27.61 
 
 		 338 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  26.32 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  28.57 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  26.49 
 
 		 535 aa  57.8  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  31.73 
 
 		 523 aa  53.5  0.000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  27 
 
 		 579 aa  51.6  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  28.14 
 
 		 301 aa  49.3  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  26 
 
 		 462 aa  46.6  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  28.66 
 
 		 571 aa  44.3  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  26.09 
 
 		 435 aa  43.5  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>