40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_3953 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  100 
 
 		 597 aa  1243    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  34.56 
 
 		 628 aa  355  1e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  34.58 
 
 		 636 aa  337  5e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  31.56 
 
 		 582 aa  291  3e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  30.87 
 
 		 630 aa  285  2.0000000000000002e-75  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  30.05 
 
 		 616 aa  280  8e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  28.67 
 
 		 625 aa  251  4e-65  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  30.33 
 
 		 609 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  30.33 
 
 		 609 aa  228  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  29.55 
 
 		 609 aa  212  1e-53  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  25.96 
 
 		 610 aa  204  5e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  37.68 
 
 		 533 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  24.1 
 
 		 579 aa  131  3e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  25.59 
 
 		 617 aa  120  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  39.39 
 
 		 500 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  27 
 
 		 591 aa  103  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  24.2 
 
 		 503 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  37.8 
 
 		 514 aa  99.4  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  34.72 
 
 		 505 aa  94  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  27.76 
 
 		 569 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  30.53 
 
 		 489 aa  90.5  8e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  23.59 
 
 		 571 aa  84.7  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  32.81 
 
 		 532 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  33.58 
 
 		 295 aa  80.1  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  25.62 
 
 		 316 aa  79.3  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  33.09 
 
 		 563 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  35.04 
 
 		 280 aa  76.3  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  32.86 
 
 		 561 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  26.43 
 
 		 477 aa  72.8  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  24.34 
 
 		 435 aa  68.6  0.0000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  23.21 
 
 		 535 aa  68.6  0.0000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  25.21 
 
 		 301 aa  67.4  0.0000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  23.29 
 
 		 515 aa  67.4  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  28.91 
 
 		 523 aa  61.6  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  23.63 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  22.51 
 
 		 338 aa  57  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  23.46 
 
 		 361 aa  49.7  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  26.67 
 
 		 569 aa  47.8  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0123  hypothetical protein  34.15 
 
 		 366 aa  45.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1214  hypothetical protein  28.21 
 
 		 495 aa  44.7  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>