38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_6969 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  100 
 
 		 617 aa  1280    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  40.58 
 
 		 338 aa  224  4e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  27.08 
 
 		 616 aa  161  3e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  25.41 
 
 		 610 aa  154  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  25.78 
 
 		 571 aa  151  3e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  24.26 
 
 		 636 aa  143  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  23.84 
 
 		 625 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  25.04 
 
 		 628 aa  141  3e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  25.43 
 
 		 630 aa  137  8e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  24.11 
 
 		 582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  25.12 
 
 		 609 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  25.12 
 
 		 609 aa  129  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  25.59 
 
 		 597 aa  120  9e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  24.63 
 
 		 609 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  25.58 
 
 		 435 aa  103  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  27.01 
 
 		 514 aa  99  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  26.14 
 
 		 533 aa  92  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  27 
 
 		 515 aa  89  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  26.69 
 
 		 569 aa  87  9e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  23.31 
 
 		 579 aa  85.5  0.000000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  26.05 
 
 		 462 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  25.04 
 
 		 591 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  23.97 
 
 		 505 aa  77.8  0.0000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  29.27 
 
 		 295 aa  74.7  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  25.83 
 
 		 500 aa  74.3  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  28.57 
 
 		 280 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  25.15 
 
 		 316 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  25.48 
 
 		 503 aa  66.6  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  28.85 
 
 		 489 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  21.09 
 
 		 523 aa  60.8  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  32.65 
 
 		 569 aa  54.3  0.000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  27.08 
 
 		 477 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  27.27 
 
 		 563 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  29.61 
 
 		 532 aa  52.4  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  22.3 
 
 		 535 aa  50.1  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  26.25 
 
 		 561 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1214  hypothetical protein  46.94 
 
 		 495 aa  48.9  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  36.96 
 
 		 301 aa  44.3  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>