42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5722 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1168    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  26.63 
 
 		 636 aa  173  9e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  24.88 
 
 		 628 aa  163  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  24.73 
 
 		 533 aa  136  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  22.4 
 
 		 625 aa  135  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  29.91 
 
 		 489 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  25.56 
 
 		 582 aa  113  8.000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  23.23 
 
 		 610 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  28.12 
 
 		 591 aa  111  3e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  26.42 
 
 		 532 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  24.63 
 
 		 617 aa  107  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  34.16 
 
 		 295 aa  100  9e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  34.59 
 
 		 280 aa  99  2e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  23.03 
 
 		 503 aa  96.7  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  26.95 
 
 		 630 aa  94.7  4e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  27.76 
 
 		 597 aa  92.8  2e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  25.94 
 
 		 523 aa  91.3  5e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  25.55 
 
 		 609 aa  87.8  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  25.55 
 
 		 609 aa  87.8  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  29.18 
 
 		 563 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  27.46 
 
 		 561 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  31.25 
 
 		 316 aa  80.5  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  22.12 
 
 		 515 aa  80.5  0.00000000000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  24.92 
 
 		 609 aa  79.3  0.0000000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  26.28 
 
 		 514 aa  77  0.0000000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  22.33 
 
 		 500 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  27.06 
 
 		 505 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  22.98 
 
 		 616 aa  69.3  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  39.18 
 
 		 579 aa  67  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  23.73 
 
 		 301 aa  60.5  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  22.81 
 
 		 477 aa  60.5  0.00000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  23.13 
 
 		 338 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  26.72 
 
 		 462 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  26.99 
 
 		 435 aa  55.5  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  28.42 
 
 		 563 aa  54.7  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1214  hypothetical protein  41.38 
 
 		 495 aa  54.7  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  29.84 
 
 		 569 aa  50.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0254  hypothetical protein  50 
 
 		 585 aa  48.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  22.62 
 
 		 361 aa  47.4  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  27.67 
 
 		 571 aa  47  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3106  transposon Tn7 transposition protein D  42.11 
 
 		 300 aa  44.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0387567 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  23.04 
 
 		 535 aa  44.7  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>