37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2922 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  100 
 
 		 515 aa  1065    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  30.14 
 
 		 505 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  29.41 
 
 		 514 aa  204  3e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  29.3 
 
 		 503 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  27.43 
 
 		 500 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  27.48 
 
 		 636 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  25 
 
 		 533 aa  121  1.9999999999999998e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  25 
 
 		 628 aa  108  3e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  26.23 
 
 		 609 aa  99.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  26.23 
 
 		 609 aa  99.8  1e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  24.07 
 
 		 582 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  27 
 
 		 617 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  28.83 
 
 		 625 aa  85.5  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  24.59 
 
 		 609 aa  84.7  0.000000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  22.24 
 
 		 489 aa  78.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  22.26 
 
 		 569 aa  77.8  0.0000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  26.72 
 
 		 591 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  31.55 
 
 		 616 aa  77  0.0000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  25.57 
 
 		 630 aa  76.3  0.000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  23.47 
 
 		 316 aa  70.5  0.00000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  23.29 
 
 		 597 aa  67.4  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  25.32 
 
 		 295 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  26.99 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  28.83 
 
 		 532 aa  59.3  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  28.3 
 
 		 563 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  22.02 
 
 		 462 aa  55.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  22.97 
 
 		 338 aa  55.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  19.05 
 
 		 610 aa  55.1  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  27.59 
 
 		 579 aa  53.9  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  25.32 
 
 		 535 aa  53.9  0.000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  26.44 
 
 		 561 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0254  hypothetical protein  32.08 
 
 		 585 aa  50.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  24.54 
 
 		 477 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  24.28 
 
 		 563 aa  47  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  27.11 
 
 		 569 aa  46.2  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  23.81 
 
 		 523 aa  43.9  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3106  transposon Tn7 transposition protein D  27.01 
 
 		 300 aa  43.5  0.01  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0387567 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>