43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1114 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  100 
 
 		 628 aa  1306    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  49.84 
 
 		 636 aa  655    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  43.06 
 
 		 625 aa  541  9.999999999999999e-153  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  37.38 
 
 		 582 aa  400  9.999999999999999e-111  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  36.15 
 
 		 616 aa  389  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  36.42 
 
 		 630 aa  388  1e-106  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  34.56 
 
 		 597 aa  363  5.0000000000000005e-99  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  31.99 
 
 		 609 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  31.99 
 
 		 609 aa  335  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  31.78 
 
 		 609 aa  328  3e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  33.28 
 
 		 610 aa  319  1e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2207  hypothetical protein  27.01 
 
 		 579 aa  211  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00234923  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  34.28 
 
 		 533 aa  208  2e-52  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  36.36 
 
 		 316 aa  188  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  34.53 
 
 		 280 aa  166  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  32.09 
 
 		 295 aa  166  2.0000000000000002e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  25.24 
 
 		 617 aa  150  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3944  transposon Tn7 transposition protein TnsD  28.04 
 
 		 505 aa  145  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4357  transposition protein  28.76 
 
 		 500 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  23.03 
 
 		 591 aa  138  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  26.79 
 
 		 514 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5192  hypothetical protein  28.16 
 
 		 489 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  26.96 
 
 		 569 aa  124  4e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5407  transposition protein, TnsD-related protein  23.69 
 
 		 532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00865323 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  27.54 
 
 		 563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3931  transposition protein  25.15 
 
 		 503 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  25 
 
 		 515 aa  108  3e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  23.65 
 
 		 571 aa  104  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  28.2 
 
 		 561 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  26.03 
 
 		 563 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6968  hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  92  3e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3105  transposon Tn7 transposition protein D  23.88 
 
 		 535 aa  86.3  0.000000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0511559 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3773  Tn7-like transposition protein  23.6 
 
 		 435 aa  85.9  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  24.83 
 
 		 477 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  24.21 
 
 		 301 aa  76.3  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1057  hypothetical protein  24.08 
 
 		 523 aa  70.1  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.047918  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  23.68 
 
 		 462 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1177  hypothetical protein  27.16 
 
 		 361 aa  62.8  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0253  hypothetical protein  21.5 
 
 		 470 aa  54.7  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.268016 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  24.32 
 
 		 569 aa  53.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3106  transposon Tn7 transposition protein D  26.58 
 
 		 300 aa  52.8  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0387567 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1214  hypothetical protein  28.83 
 
 		 495 aa  51.6  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0254  hypothetical protein  41.86 
 
 		 585 aa  43.9  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.16241 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>