33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6777 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010512  Bcenmc03_6777  hypothetical protein  100 
 
 		 569 aa  1168    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5721  transposition protein, TnsD-like protein  28.71 
 
 		 561 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.90008  normal  0.362821 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2324  Tn7-like transposition protein D  28.26 
 
 		 295 aa  69.7  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.61974e-16 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7024  transposition protein, TnsD-like protein  40 
 
 		 563 aa  67.8  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.39846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3950  Tn7-like transposition protein D  27.72 
 
 		 280 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3489  Tn7-like transposition protein D  28.64 
 
 		 316 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0155842  normal  0.0624831 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6940  hypothetical protein  32.31 
 
 		 591 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100995  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5566  transposition protein, TnsD-related protein  25.42 
 
 		 563 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0143  hypothetical protein  26.95 
 
 		 533 aa  62.4  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0185  Tn7-like transposition protein D  29.38 
 
 		 582 aa  61.2  0.00000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.156769  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4321  hypothetical protein  31.45 
 
 		 477 aa  57.4  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3495  Tn7-like transposition protein D  26.06 
 
 		 636 aa  57  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.178202  normal  0.0885981 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3186  hypothetical protein  45.61 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.174056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1871  Tn7-like transposition protein D  26.58 
 
 		 625 aa  54.7  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6969  hypothetical protein  32.65 
 
 		 617 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2800  Tn7-like transposition protein D  28.74 
 
 		 609 aa  53.9  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3196  Tn5468, transposition protein D  28.74 
 
 		 609 aa  53.9  0.000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.480542  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1114  Tn7-like transposition protein D  24.44 
 
 		 628 aa  53.1  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1204  Tn5468, transposition protein D  29.65 
 
 		 609 aa  52.4  0.00002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5722  hypothetical protein  29.84 
 
 		 569 aa  50.1  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.606604 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0178  Tn7-like transposition protein D  31.43 
 
 		 610 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.909766  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6545  hypothetical protein  28.84 
 
 		 322 aa  49.7  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.329804 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3953  Tn7-like transposition protein D  26.67 
 
 		 597 aa  47.8  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1645  hypothetical protein  27.12 
 
 		 342 aa  47.8  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3956  hypothetical protein  35.59 
 
 		 301 aa  47.8  0.0006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0248  Tn7-like transposition protein D  23.72 
 
 		 630 aa  47.4  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.194632 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2922  hypothetical protein  27.11 
 
 		 515 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3774  putative transposon transposition protein  28.4 
 
 		 571 aa  44.7  0.004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3825  transposition protein  25.75 
 
 		 514 aa  44.7  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.365927  hitchhiker  0.00340048 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0177  Tn7-like transposition protein D  23.81 
 
 		 616 aa  43.9  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.170656  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4742  hypothetical protein  29.23 
 
 		 438 aa  43.9  0.009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4973  hypothetical protein  27.05 
 
 		 462 aa  43.5  0.009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4508  hypothetical protein  27.13 
 
 		 306 aa  43.9  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>